工伤期间只发底薪不合法。依据《工伤保险条例》，停工留薪期内原工资福利待遇不变。若不及时处理，将损害员工合法权益，影响工伤恢复及生活。
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工伤底薪问题需解决。具体操作：1. 首先与用人单位沟通，要求按原工资福利待遇支付；2. 若沟通无果，收集工资单、工伤认定等证据；3. 向当地劳动保障行政部门投诉，并提交相关证据；4. 等待行政部门调查处理，必要时可申请劳动仲裁。
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工伤期间工资问题常见处理方式为投诉或协商。可选择向劳动保障行政部门投诉，或先与用人单位协商解决，协商无果再投诉。